可憐的豬。我們將其歸咎于它在2012年給我們帶來(lái)了豬流感，一種豬冠狀病毒，以及在某些古老的棚屋中造成沙門氏菌的沙門氏菌，沙門氏菌會(huì)引起腸道不適和傷寒。但是，現(xiàn)在看來(lái)，幾千年前，人類首先獲得了沙門氏菌，并且可能已經(jīng)將其傳給了豬。

一項(xiàng)新的研究表明，歐亞大陸的早期農(nóng)民從狩獵和采集的游牧方式轉(zhuǎn)為耕作時(shí)，給自己帶來(lái)了一種更致命的沙門氏菌。通過(guò)與家畜及其廢物在近處安頓下來(lái)，他們給了沙門氏菌腸菌(Salmonella enterica)，它潛伏在一個(gè)未知的動(dòng)物宿主中，可以很容易地接觸到適應(yīng)人類的人類腸道。豬后來(lái)可能從人或另一只動(dòng)物身上拾取了病原體。

長(zhǎng)期以來(lái)，研究人員一直認(rèn)為，從覓食向農(nóng)業(yè)的過(guò)渡使人類更加惡心。依靠一些農(nóng)作物和家畜，早期農(nóng)民的飲食和狩獵者采集的食物相比，飲食變化和健康程度更低。他們還靠近病原體持續(xù)存在的人類和動(dòng)物糞便。但是很少有傳染性疾病在骨骼上留下痕跡，因此這些病原體很難在化石中發(fā)現(xiàn)。

在一項(xiàng)技術(shù)突破中，由人口遺傳學(xué)家Felix Key和Johannes Krause以及馬克斯·普朗克人類歷史科學(xué)研究所的細(xì)菌基因組學(xué)家Alexander Herbig領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一種稱為HOPS的方法，用于檢測(cè)致病細(xì)菌中的古代DNA片段。Key，現(xiàn)任美國(guó)麻省理工學(xué)院的Herbig團(tuán)隊(duì)使用此方法篩選了距歐洲，俄羅斯和土耳其6500多年歷史的2739名人類牙齒中的細(xì)菌DNA。從這些牙齒上，他們能夠重建八個(gè)腸炎鏈球菌基因組。

當(dāng)研究人員將這些基因組分類到沙門氏菌的家譜中時(shí)，沙門氏菌有2500多個(gè)菌株，他們發(fā)現(xiàn)來(lái)自古代農(nóng)民和牧民的所有六個(gè)腸炎沙門氏菌基因組都?xì)w為一組。但是來(lái)自俄羅斯6500年歷史的覓食者的兩個(gè)腸炎沙門氏菌基因組又落入其他群體，其中一個(gè)帶有導(dǎo)致馬和羊流產(chǎn)的毒株。生活在5500至1600年前的農(nóng)民中感染的菌株包括副傷寒C的祖先，該菌株引起致命的腸熱，類似于今天的傷寒。

研究人員不知道哪個(gè)動(dòng)物宿主把它給人類最初，但它可能不是豬，它們攜帶著只有4000年前出現(xiàn)了一個(gè)密切相關(guān)的應(yīng)變，根據(jù)該分子約會(huì)沙門氏菌家譜，如今研究人員報(bào)告在自然生態(tài)與進(jìn)化。

古代副傷寒C的祖先菌株尚未專門適應(yīng)人類：病原體感染了許多動(dòng)物，并且缺乏引起傷寒樣發(fā)熱的基因。這表明人類最初患有一種較溫和的疾病，也感染了他們的牲畜。

亞利桑那州立大學(xué)坦佩分校的人類遺傳學(xué)家安妮·斯通(Anne Stone)希望，研究小組可以從覓食者身上提取更多的腸炎沙門氏菌樣本。但新研究揭示了細(xì)菌病原體如何轉(zhuǎn)移宿主，斯通說(shuō)。她說(shuō)，它還可以幫助研究人員更多地了解病原體何時(shí)何地從另一種物種跳入人類的原因，這是鑒于當(dāng)前冠狀病毒爆發(fā)的及時(shí)教訓(xùn)。