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3月2日訪問學者JohnKress評估了迄今為止對植物的有限測序

根據(jù)一篇總結了關于綠色植物基因組的已知信息以及植物學家如何提高賭注的評論論文,科學家們知道的植物的完整基因組序列遠少于其他生命形式 。

這篇論文出現(xiàn)在美國國家科學院院刊的特刊中,該 論文是地球生物基因組計劃 (EBP) 的進展報告,這是一個旨在最終“對所有生命的 DNA 進行測序”的國際聯(lián)盟。著名植物分類學家 John Kress 是 EBP 的聯(lián)合主席,也是該評論論文的資深作者,目前是達特茅斯學院的訪問學者。

“地球生物基因組計劃實際上是跨領域對生命進行采樣,無論是動物、真菌還是植物,”克雷斯說??茖W家們希望在短短 10 年內對驚人的 180 萬個已知物種的代表性個體的基因組進行測序。該項目于三年前啟動,不僅將匯集現(xiàn)有的全球基因組測序工作,還將建立快速樣本收集、標準化 DNA 測序和公平共享數(shù)據(jù)的手段。

“我們的想法是在 10 年內為每個物種生成完整的參考基因組,”克雷斯說。參考基因組是 DNA 藍圖,可作為物種個體基因的代表性示例。

克雷斯說,有了這樣一個針對每個物種的藍圖,研究人員就可以開始回答一些主要的科學問題,例如進化是如何運作的,或者物種如何在群落中相互作用。

科學、健康和商業(yè)也有無數(shù)潛在的好處。“無論您是科學家,還是從事農業(yè)、林業(yè)、漁業(yè)或保護工作,擁有基因組信息現(xiàn)在都是非?;厩冶夭豢缮俚牟襟E,”Kress 解釋說。

植物基因組提出了一個特殊的挑戰(zhàn)??死姿拐f,它們往往比動物基因組更大、更復雜。據(jù)估計,綠色植物有近 50 萬種,但已知的完整基因組序列不到 1000 種。

在他們的論文中,克雷斯和他的合著者總結了關于植物基因組的已知信息,確定了重大問題,并制定了生成基因組的各種路線圖。標準化——確保 DNA 數(shù)據(jù)的生成和存儲方式使得不同實驗室可以輕松比較它們——是關鍵步驟。

克雷斯希望沿途的技術改進將有助于使項目保持在正軌上。人類基因組計劃花費了 10 多年的時間來對一個基因組進行測序,但現(xiàn)在,他說,“我們可以在一周內完成。”

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