根據(jù)來(lái)自全球119位微生物學(xué)家支持的一項(xiàng)新的共識(shí)聲明,為細(xì)菌和古細(xì)菌分配科學(xué)名稱的長(zhǎng)期規(guī)則已經(jīng)過(guò)期。
細(xì)菌和古細(xì)菌(缺乏細(xì)胞核的單細(xì)胞生物)構(gòu)成了地球上三個(gè)生命域中的兩個(gè),并根據(jù)國(guó)際原核生物命名法(ICNP;該法典)進(jìn)行命名。目前,該規(guī)范僅識(shí)別可以從實(shí)驗(yàn)室文化中培育出來(lái)的物種-對(duì)于研究野外細(xì)菌和古細(xì)菌的微生物學(xué)家而言,這一要求長(zhǎng)期以來(lái)一直是個(gè)難題。
自1980年代以來(lái),微生物學(xué)家一直使用遺傳測(cè)序技術(shù)從環(huán)境中直接采樣和研究微生物的DNA,這些環(huán)境遍及從地球冰冷的海洋到深層地下礦山再到人類皮膚表面的各種生境。對(duì)于這些物種中的絕大多數(shù),尚無(wú)在實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行培養(yǎng)的方法,因此,根據(jù)《守則》,不能正式命名它們。
艾莉森·默里(Alison Murray)表示:“近年來(lái),從環(huán)境中收集的古細(xì)菌和細(xì)菌的基于基因組的發(fā)現(xiàn)激增,但沒(méi)有正式的系統(tǒng)對(duì)其正式命名,這在該領(lǐng)域造成了很多混亂和混亂。”里諾沙漠研究所(DRI)生物學(xué)博士,博士。“能夠用一種共同的語(yǔ)言來(lái)代表其基因組序列所知的未耕種生物的多樣性非常重要。”
在本周發(fā)表在《自然微生物學(xué)》雜志上的一篇文章中,穆雷和她的合作者介紹了更新有關(guān)命名細(xì)菌和古細(xì)菌新物種的現(xiàn)有法規(guī)的理由,并提出了兩種可能的發(fā)展途徑。
作為第一種選擇,該小組提議正式修訂該規(guī)范,以包括以DNA序列信息表示的未培養(yǎng)細(xì)菌和古細(xì)菌,以代替當(dāng)前所需的活培養(yǎng)物樣品。作為替代方案,他們建議為未栽培的生物創(chuàng)建一個(gè)完全獨(dú)立的命名系統(tǒng),該體系可以在將來(lái)的某個(gè)時(shí)候與《守則》合并。
內(nèi)華達(dá)大學(xué)拉斯維加斯分校生命科學(xué)教授Brian Hedlund博士說(shuō):“對(duì)于這一領(lǐng)域的研究人員而言,采用上述兩種方法中的任何一種都會(huì)帶來(lái)巨大的好處。”“我們將能夠創(chuàng)建一個(gè)統(tǒng)一列表,列出過(guò)去幾十年來(lái)發(fā)現(xiàn)的所有未栽培物種,并為如何命名新物種以及何時(shí)命名實(shí)施普遍質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。”
例如,使用DNA測(cè)序研究人類微生物組的研究人員,即生活在體內(nèi)和人體上的成千上萬(wàn)種細(xì)菌和古細(xì)菌,將有一種方法為他們確定的尚未代表的物種分配正式名稱。在文化收藏中。這將提高世界范圍內(nèi)的研究人員就諸如不同人群的飲食與腸道細(xì)菌之間的聯(lián)系等主題開(kāi)展協(xié)作研究的能力,或者以先前的研究為基礎(chǔ)。
波特蘭生物學(xué)教授Anna-Louise Reysenbach博士說(shuō):“它為提供一種結(jié)構(gòu)化的方法,為在科學(xué)界內(nèi)部和整個(gè)公共領(lǐng)域交流微生物世界中尚未開(kāi)發(fā)的廣闊生物多樣性奠定了基礎(chǔ)。”州立大學(xué)。“這就是為什么這種變化如此重要的原因。”
本文和擬議的計(jì)劃是由美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)資助的一系列研討會(huì)的最終成果。默里說(shuō),下一步是找出實(shí)施戰(zhàn)略,以推進(jìn)兩個(gè)擬議計(jì)劃中的一個(gè),同時(shí)讓許多為這一共識(shí)聲明做出貢獻(xiàn)的微生物學(xué)家以及世界各地希望幫助實(shí)現(xiàn)這一改變的其他人參與進(jìn)來(lái)。到目前為止,許多人都渴望參加。
穆雷說(shuō):“這是一個(gè)令人興奮的領(lǐng)域,因?yàn)槲覀冋诿枋龅厍蛏系纳锒鄻有圆l(fā)現(xiàn)新的門,就像科學(xué)家回到1800年代時(shí)仍在發(fā)現(xiàn)更大的生物一樣。”“許多范式一直在改變我們對(duì)世界運(yùn)作方式的理解以及那里存在多少多樣性-這是需要做出的另一種改變。我們將需要改變它,否則我們將要改變。生活在混亂中。”